Brakujące ogniwo (The Missing Link) to pierwsze, w pełni samodzielne rozszerzenie Buntu Ludzkości, co oznacza, że do jego uruchomienia nie jest konieczne
posiadanie podstawowej wersji gry. Przygoda nie jest bezpośrednią kontynuacją wydarzeń przedstawionych w pierwowzorze, ale często się do niej odwołuje,
wplatając nowe informacje w doskonale już znane wątki.
Akcja rozpoczyna się tuż po zamachu bombowym, którego Adam Jensen dokonał w porcie w Hengshy. Po
ucieczce na statek bohater chowa się w kapsule kriogenicznej, ale świadomi jego obecności agenci Belltower, dokonują przechwycenia śmiertelnie
niebezpiecznego pasażera. Po serii brutalnych przesłuchań, Jensen zostaje uwolniony przez tajemniczego sprzymierzeńca i rozpoczyna ucieczkę z pełnego wrogów
frachtowca.
Mimo zupełnie niezależnej fabuły, Brakujące Ogniwo mocno przeplata się z niektórymi wątkami Buntu ludzkości, dlatego zaleca się eksploatację
dodatku dopiero po ukończeniu pierwowzoru. Na potrzeby rozszerzenia autorzy pozbawili Jensena wszystkich nadnaturalnych mocy, więc można dokonać ponownego
rozwoju bohatera. Oprócz statku, w The Missing Link zwiedzimy również tajną bazę organizacji Belltower, w tym znakomicie prezentujące się więzienie.
Ukończenie przygody w wariancie skradankowym zajmuje około sześciu godzin.